L'Autorité de Sureté Nucléaire et de Radioprotection (ASNR), anciennement Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN) est un acteur de premier plan dans les domaines des activités nucléaires et de la radioprotection, à la fois centre de recherche et pôle d'expertise pluridisciplinaire rassemblant plus de 1 800 personnes.
Le stage aura lieu dans le Laboratoire de Radiobiologie des expositions Accidentelles (LRAcc) lequel fait partie du Service de recherche en radiobiologie et en médecine régénérative, de la Direction Santé de la nouvelle ASNR. Le laboratoire est situé à Fontenay-aux-Roses et mène des recherches en radiobiologie, en dosimétrie biologique, en radiopathologie et en médecine régénérative dans un contexte d'exposition accidentelle aux rayonnements ionisants (accident radiologique - industriel, médical ou nucléaire -, acte de malveillance), afin de développer des capacités d'expertise pour la prise en charge médicale des victimes.
Depuis quelques années, de nombreuses méthodes d'analyses de données bioinformatiques, notamment d'enrichissement fonctionnels sont apparues dans la littérature permettant de déterminer si une fonction/mécanisme biologique connu(e) est sur-représenté(e) dans des données expérimentales. Ces outils se divisent en trois classes différentes : les méthodes Over-Representation Analysis (ORA), les méthodes Functional Class Scoring (FCS) et les méthodes basées sur la topologie des voies (TP).

Vous intégrerez une équipe pluridisciplinaire, et participerez à des activités de recherches en bioinformatiques afin de faciliter la compréhension des effets d'une exposition accidentelle à des rayons ionisants.
L'objectif principal de ce stage est d'identifier des fonctions biologiques impliquées dans la réponse aux rayons ionisants dans des données transcriptomiques à l'aide d'outils topologiques. Dans un premier temps, le candidat devra prendre en main plusieurs de ces outils d'enrichissement, en passant par le package R graphite, et les bases de données qui leur sont associées (KEGG, WikiPathways, Reactome, etc.), et appliquer ces méthodes sur des données transcriptomiques obtenues dans les conditions irradié vs control afin de caractériser la réponse aux rayons ionisants. Dans un second temps, l'étudiant aura l'occasion d'implémenter une interface R shiny qui facilitera l'accès aux outils d'enrichissement par les autres membres du laboratoire dans le cadre de divers projets.

Le candidat doit avoir un niveau Master 1 en Bio-informatiques ou diplôme équivalent avec des bases solides en Biologie et en Informatiques. L'étudiant doit également avoir des connaissances en analyses de données transcriptomiques et maitriser le langage de programmation R. Organisé et autonome, le candidat doit savoir travailler au sein d'une équipe et avoir de bonnes capacités de rédaction et de lecture d'articles scientifiques en anglais.

La diversité est une des composantes de la politique RSE, RH et Qualité de Vie au Travail à l’ASNR.

Nous accordons la même considération à toutes les candidatures, sans discrimination, pour inclure tous les talents.

Quelles que soient les différences, nous souhaitons attirer, intégrer et fidéliser nos candidats et nos collaborateurs au sein d’un environnement de travail inclusif.

L'ASNR conduit une politique active depuis de nombreuses années en faveur de l'égalité des chances au travail et l'emploi des personnes handicapées. Si vous êtes en situation de handicap, n'hésitez pas à nous faire part de vos éventuels besoins spécifiques afin que nous puissions les prendre en compte